Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPDP35247 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPDP35247 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPDP35247 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPDP35247 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPDP35247 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPDP35247 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFTPDP35247 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFTPDP35247 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFTPDP35247 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFTPDP35247 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFTPDP35247 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFTPDP35247 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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