Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

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Length 1,406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP6P35125 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP6P35125 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP6P35125 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP6P35125 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP6P35125 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP6P35125 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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