Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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