Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms