Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO2P25791 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LMO2P25791 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO2P25791 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms