Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA4P25789 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms