Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms