Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA6P23229 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms