Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME1P15531 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME1P15531 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms