Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms