Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms