Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSD2O96028 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms