Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPLO60437 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPLO60437 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPLO60437 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPLO60437 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms