Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCAO15360 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCAO15360 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCAO15360 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCAO15360 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCAO15360 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCAO15360 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms