Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVH48-1M5A8F1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms