Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4E171 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms