Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms