Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms