Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPC1L1Q9UHC9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms