Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms