Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms