Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms