Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms