Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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