Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CEP44Q9C0F1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms