Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms