Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms