Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms