Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms