Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD2Q9BSE4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms