Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms