Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms