Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms