Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms