Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGD4Q96M96 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms