Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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C2orf48Q96LS8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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C2orf48Q96LS8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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C2orf48Q96LS8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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C2orf48Q96LS8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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C2orf48Q96LS8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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