Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms