Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSLPQ969D9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSLPQ969D9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSLPQ969D9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms