Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ZNF248Q8NDW4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ZNF248Q8NDW4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ZNF248Q8NDW4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ZNF248Q8NDW4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ZNF248Q8NDW4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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