Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms