Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms