Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC2Q8IXK0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC2Q8IXK0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms