Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL3Q8IVW4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms