Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms