Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms