Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q71RC1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q71RC1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms