Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms