Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms