Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms