Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms